Tổ chức y tế thế giới ước tính hàng năm có khoảng 90 triệu ca nhiễm



tải về 361.36 Kb.
trang7/7
Chuyển đổi dữ liệu19.09.2016
Kích361.36 Kb.
#32268
1   2   3   4   5   6   7

KẾT LUẬN


1. Đã chọn được các điều kiện tối ưu cho phản ứng PCR về nhiệt độ gắn mồi, thời gian gắn mồi, nồng độ MgCl2 và số chu kỳ tối ưu nhất cho một phản ứng PCR phát hiện vi khuẩn C.trachomatis.

2. Đánh giá được độ nhạy của phản ứng PCR phát hiện được mẫu có chứa 10 thể cơ bản (EB) của vi khuẩn C.trachomatis.

3. Đánh giá được độ đặc hiệu của kỹ thuật PCR đối với vi khuẩn C.trachomatis là 100%.

4. Xác định được tỷ lệ nhiễm C.trachomatis ở bệnh nhân có biểu hiện viêm âm đạo, cổ tử cung là 36.9%.



TÀI LIỆU THAM KHẢO


Tiếng Việt

  1. Phạm Đông An (1996). Viêm nhiễm cổ tử cung do Chlamydia trachomatis ở phụ nữ mang thai, Luận văn tốt nghiệp bác sỹ y khoa, Trung tâm đào tạo và bồi dưỡng cán bộ y tế.

  2. Bộ Y Tế (2007), “Vi sinh vật Y học”, Nhà xuất bản Y học.

  3. Lê Hồng Cẩm (2002). Nghiên cứu tỷ lệ viêm cổ tử cung do Chlamydia trachomatis và một số yếu tố kết hợp ở phụ nữ trong lứa tuổi sinh đẻ tại huyện Hóc Môn, Luận án tiến sỹ y học, Đại học Y Dược TP Hồ Chí Minh.

  4. Phạm Văn Đức (2007). “ Tỷ lệ nhiễm Chlamydia trachomatic ở phụ nữ hút thai ba tháng đầu thai kỳ và các yếu tố liên quan”, Tạp chí y học TP Hồ Chí Minh, tập 13 (1), trang 17-22.

  5. Nguyễn Phúc Như Hà, “Ứng dụng các kỹ thuật sinh học phân tử chẩn đoán bệnh phong và các bệnh lây truyền qua đường tình dục tại bệnh viện phong- da liễu Trung ương Quy Hòa”. Bệnh viện phong- da liễu Trung ương Quy Hòa.

  6. Nguyễn Thanh Hùng, Nguyễn Trọng Hào, Nguyễn Ngọc Bá, “Giá trị chẩn đoán của test nhanh (quick test-USA) so với PCR (công ty Nam Khoa- Việt Nam) trong chẩn đoán nhiễm Chlamydia trachomatis ở bệnh nhân đến khám tại bệnh viện Da liễu thành phố Hồ Chí Minh”. Bệnh viện Da liễu thành phố Hồ Chí Minh.

  7. Trần Hậu Khang, Phạm Đăng Bảng, Lê Huyền My, viện Da liễu Quốc gia (2009), “Áp dụng kỹ thuật PCR trong chẩn đoán nhiễm Chlamydia trachomatis đường sinh dục tiết niệu”, Tạp chí y học thực hành, 1, trang 641- 642.

  8. Trần Thị Lợi (2000). “Sơ bộ khảo sát tình hành nhiễm Chlamydia trachomatis trong viêm sinh dục “ Tạp chí Y học TP Hồ Chí Minh, Tập 4 (1): trang 14-18

  9. Đặng Chi Mai (2003). “ Chlamydiae”. Vi khuẩn học. Đại học Y dược TP Hồ Chí Minh, trang 176-176.

  10. Nguyễn Văn Thục, “Dịch tễ học bệnh lây truyền qua đường tình dục và nhiễm HIV ở khu vực phía Nam Việt Nam: Một số vấn đề nổi cộm”. Viện Pasteur thành phố Hồ Chí Minh.

Tiếng Anh

  1. Achchhe L Patel, Divya Sachdev, Poonam Nagpal, Uma Chaudhry, Subash C Sonkar, Suman L Mendiratta and Daman Saluja (2010),Prevalence of Chlamydia infection among women visiting a gynaecology outpatient department: evaluation of an in-house PCR assay for detection of Chlamydia trachomatis”, Annals of clinical microbiology and antimicrobials, 9 (24),

  2. Anahita Jenab, Naser Golbang, Pouran Golbang, Leili Chamani-Tabriz, M.PH, Rasoul Roghanian (2009), “Diagnostic Value of PCR and ELISA for Chlamydia trachomatis in a Group of Asymptomatic and Symptomatic Women in Isfahan, Iran”, Royan Institue International Journal of Fertility and Sterility Vol 2, (4), pp. 193-198.

  3. Bass CA, Jungkind DL, Silverman NS (1993), “Clinical evaluation of a new polymerase chain reaction assay for detection of Chlamydia trachomatis in endocervical specimens”. J Clin Microbiol; 31, pp. 2648-2653.

  4. Boom R. et al., (1990), “Rapic and simple method for purification of nucleic acids”, J. Clin. Microbiol., vol. 28 no. 3, pp. 495-503.

  5. European Centre for Disease prevention and Control (2008), Technical report review of Chlamydia control activities in EU countries, Stockholm.

  6. Farhad B. Hashemi, BabakPourakbari, and JavadZaeimiYazdi (2007), “Frequency of Chlamydia trachomatis in Women with Cervicitis inTehran, Iran”, Infectious Diseases in Obstetrics and Gynecology Vol 2007, 4 pp

  7. Frost EH, Deslandes S, Bourgaux-Ramoisy D (1993), “Sensitive detection and typing of Chlamydia trachomatis using nested polymerase chain reaction”. Genitour in Med, 69, pp 290-294.

  8. James B. Mahony, Kathleen E Luinstra, John W. Sellors, Dan Jang, and Max A. Chernesky (1992), “Confirmatory Polymerase Chain Reaction Testing for Chlamydia trachomatis in First-Void Urine from Asymptomatic and Symptomatic Men”, Journal of clinical microbiology, pp. 2241-2245.

  9. Joanne Rampersad, Xiaohui Wang, Helen Gayadeen, Samuel Ramsewak, and David Ammons (2007), “In-house polymerase chain reaction for affordable and sustainable Chlamydia trachomatis detection in Trinidad and Tobago”, Ammons Rev Panam Salud Publica, 22(5), pp. 317- 322.

  10. J.S Wilson, E.Honey, A. Templeton, J.Paavonen, P.A. Mardh, A.Stary and B.Stray- Pedesen (2002), “A systematic review of the prevalence of Chlamydia trachomatis among European women”, Human Reproduction update, Vol 8, (4), pp. 385-394.

  11. Loeffelholz MJ, Lewinski CA, Silver SR, (1992), Detection of Chlamydia trachomatis in endocervical specimens by polymerase chain reaction”. J. Clin Microbiol, 30, pp. 2847-2851.

  12. Pamela Cribb, Juan Pablo Scapini, Esteban Serra (2002), “One-tube nested Polymerase Chain Reaction for detection of Chlamydia trachomatis”, Mem Inst Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Vol. 97(6), pp. 897-900.

  13. Saiki RK et al., (1985), “Enzymatic amplification of beta-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia”, Science, 230, pp. 1350-1354.

  14. Nguyen Thi Thanh Thuy, Vo Tuyet Nhung, Nguyen Van Thuc, Truong Xuan Lien and Ha Ba Khiem (1998), “HIV infection and risk factors among female sex workers in southern Vietnam”, AIDS, 12, pp. 425-432.

  15. Huynh Thi Trong, Nguyen Quoc Chinh and Nguyen Van Tu (2002), Prevalence of lower reproductive tract infections among married childbearing-age women in Ho Chi minh City.

  16. Vietnam Commission for Population, Family and Children – Ministry of Health AIDS Division and Pasteur Institute Ho Chi Minh City. STI/HIV survey among female sex workers in 5 border provinces, Vietnam, 2002. Medical Publishing House, 2003.

Tài liệu tham khảo khác

  1. www.cfsh.ca/files/PDF/chlamydia in canada.pdfTương tự 

  2. www.pasteur-hcm.org.vn/anpham/anpham.htm

  3. www.pasteur-hcm.org.vn/anpham/dichtehoc_blqdtd.htm

  4. www.quyhoandh.org.vn

  5. www.hosrem.org.vn/index.php?...chlamydia...nhan

  6. www.cicatelli.org/.../CHLAMYDIATESTINGTECHNOLOGIES012007.pdf

  7. www.advms.pl/?q=system/files/30_52Bulhak-Koziol.pdf

  8. http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Chlamydia_trachomatis

  9. www.vsmmb.com/data/upload_file/File/.../PCR_basic.pdf



MỤC LỤC

MỞ ĐẦU 1

Chương 1: TỔNG QUAN 3

1.1. Vi khuẩn Chlamydia trachomatis. 3

( Theo Deborah Dean et al., (2009) Predicting Phenotype and Emerging Strains among Chlamydia trachomatis Infections, CDC Home Vol. 15.(9)) 3

1.2. Các xét nghiệm chẩn đoán vi khuẩn Chlamydia trachomatis [32] 6



1.2.1. Nuôi cấy 6

1.2.2. Kỹ thuật miễn dịch gắn enzyme (enzyme immu­noassays– EIAs) 7

1.2.3. Kỹ thuật kháng thể huỳnh quang trực tiếp (direct fluorescent antibody- DFA) 8

1.2.4. Kỹ thuật khuếch đại nucleic acid (nucleic acid amplification tests– NAATs). 8

1.3. Các nghiên cứu về Chlamydia trachomatis trên thế giới và trong nước 9

1.3.1. Các nghiên cứu trên thế giới 9

1.3.2. Các nghiên cứu trong nước 18

Chương 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 23

2.1. ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU 23



2.1.1. Đối tượng nghiên cứu 23

2.1.2. Thời gian nghiên cứu: từ 01/04/2011. 23

2.1.3. Địa điểm nghiên cứu 23

2.2. PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 23



2.2.1. Phương pháp chọn mẫu và cỡ mẫu 23

2.2.2. Kỹ thuật xét nghiệm 24

2.2.2.1. Phương pháp lấy mẫu 24

2.2.2.2. Xử lý mẫu 24

2.2.2.3. Tách chiết ADN 24

2.2.2.4. Tối ưu hóa phản ứng PCR 25

2.2.2.5. Xác định độ nhạy của phản ứng PCR 29

2.2.2.7. Xác định tỷ lệ nhiễm Chlamydia trachomatis ở bệnh nhân viêm âm đạo, cổ tử cung đến khám tại bệnh viện Đại học Y Thái Bình từ tháng 4 đến tháng 10 năm 2011 30

2.2.2.8. Điện di, phân tích kết quả 30



2.2.3. Xử lý số liệu 31

Số liệu được xử lý bằng phần mềm SPSS 11.5. Trong quá trình phân tích số liệu, chúng tôi sử dụng các test t-test, F-test để kiểm định ý nghĩa thống kê. 31

Chương 3: KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN 32

3.1. Tối ưu hóa phản ứng PCR phát hiện Chlamydia trachomatis 32



Để một phản ứng PCR đạt hiệu quả tốt trong thời gian ngắn nhất, chúng tôi thực hiện phản ứng PCR nhằm tối ưu các điều kiện (nồng độ mồi, nhiệt độ và thời gian gắn mồi, số chu kỳ lặp lại và nồng độ MgCl2) thích hợp đối với từng cặp mồi. 32

3.1.1. Nồng độ MgCl2 32

3.1.2. Nồng độ mồi 34

3.1.3. Thời gian và nhiệt độ gắn mồi 36

Nhiệt độ gắn mồi 36



3.1.4. Số chu kỳ 39

3.2. Độ nhạy của kỹ thuật PCR 42

3.3. Độ đặc hiệu của kỹ thuật PCR 43

3.4. Kết quả xét nghiệm bằng kỹ thuật PCR 43



KẾT LUẬN 47

TÀI LIỆU THAM KHẢO 48


DANH MỤC BẢNG BIỂU, HÌNH VẼ

Hình 1.1. Cấu trúc hệ gen của vi khuẩn Chlamydia trachomatis……………………...3

Hình 1.2. Chu kỳ vòng đời của vi khuẩn C.trachomatis………………………………..4

Hình 1.3. Tỷ lệ nhiễm C.trachomatis ở một số nước Châu Âu……………………10

Hình 3.1. Ảnh điện di kết quả tối ưu nồng độ MgCl2 với cặp mồi KL1/KL2…….34

Hình 3.2. Ảnh điện di kết quả tối ưu nồng độ MgCl2 với cặp mồi KL5/KL6…….35

Hình 3.3. Ảnh điện di kết quả tối ưu nồng độ mồi KL5/KL6……………………..36

Hình 3.4. Ảnh điện di kết quả tối ưu nồng độ mồi KL1/KL2……………………..36

Hình 3.5. Ảnh diện di kết quả tối ưu nhiệt độ gắn mồi KL1/KL2………………...38

Hình 3.6. Ảnh diện di kết quả tối ưu nhiệt độ gắn mồi KL5/KL6………………..38

Hình 3.7. Ảnh diện di kết quả tối ưu thời gian gắn mồi KL5/KL6……………….39

Hình 3.8. Ảnh diện di kết quả tối ưu thời gian gắn mồi KL1/KL2…………….….40

Hình 3.9. Ảnh diện di kết quả tối ưu chu kỳ phản ứng……………………………40

Hình 3.10. Ảnh diện di độ nhạy phản ứng PCR hai lần trên vi khuẩn C. trachomatis……43

Hình 3.11. Kết quả xét nghiệm trên mẫu bệnh phẩm…………………………..…45

Bảng 3.1. Thành phần phản ứng PCR lần thứ nhất……………………………..…41

Bảng 3.2. Chu trình nhiệt của phản ứng PCR lần thứ nhất…………………….….42

Bảng 3.3. Thành phần phản ứng PCR lần 2…………………………………….…42

Bảng 3.4. Chu trình nhiệt của phản ứng PCR lần 2……………………………….43

Bảng 3.5. Kết quả xét nghiệm C.trachomatis…………………………………….45

Bảng 3.6. Tỷ lệ nhiễm C.trachomatis theo độ tuổi………………………………..46

Bảng 3.7. Tỷ lệ nhiễm C.trachomatis theo khu vực……………………………….47

Lêi c¶m ¬n

Trong qu¸ tr×nh häc tËp, nghiªn cøu vµ hoµn thµnh luËn v¨n nµy t«i ®· nhËn ®­îc sù d¹y b¶o tËn t×nh cña c¸c thÇy c«, sù gióp ®ì cña c¸c b¹n ®ång nghiÖp, sù ®éng viªn to lín cña gia ®×nh vµ nh÷ng ng­êi th©n.

Víi lßng kÝnh träng vµ biÕt ¬n s©u s¾c, T«i xin tr©n träng c¶m ¬n GS. TS. L­¬ng Xu©n HiÕn- ng­êi thÇy mÉu mùc tËn t©m ®· trùc tiÕp h­íng dÉn, d×u d¾t t«i tõng b­íc tr­ëng thµnh trªn con ®­êng häc tËp, nghiªn cøu khoa häc còng nh­ trong cuéc sèng.

T«i xin ch©n thµnh c¶m ¬n PGS.TS Ph¹m Ngäc Kh¸i, ThS NguyÔn Nam Th¾ng vµ c¸c c¸n bé trong Trung t©m DÞch vô Khoa häc kü thuËt Y d­îc- tr­êng §¹i häc Y Th¸i B×nh ®· tËn t×nh chØ b¶o vµ cho t«i nh÷ng ý kiÕn quÝ b¸u trong qu¸ tr×nh thùc hiÖn luËn v¨n.

T«i xin bµy tá lßng biÕt ¬n tíi toµn thÓ c¸c thÇy, c« gi¸o, c¸c ®ång nghiÖp vµ b¹n bÌ ®· nhiÖt t×nh gióp ®ì t«i trong qu¸ tr×nh häc tËp vµ nghiªn cøu.

Cuèi cïng, t«i xin dµnh tÊt c¶ t×nh yªu th­¬ng vµ lßng biÕt ¬n s©u nÆng nhÊt cho cha mÑ, chång vµ nh÷ng ng­êi th©n trong gia ®×nh- nh÷ng ng­êi lu«n ë bªn t«i, lu«n hÕt lßng v× t«i.



TrÇn ThÞ Hßa

BẢNG CHỮ VIẾT TẮT

C. trachomatis

Chlamydia trachomatis

DFA

Direct Fluorescent Antibody

EIAs

Enzyme Immuno Assays

LPS

Lipopolysaccharide

MOMP

Major Outer Membrane Protein

NAATs

Nucleic Acid Amplication Tests

PCR

Polymerase Chain Reaction

TPHA

Treponema Pallidum Hemagglutination Assay







Каталог: files -> ChuaChuyenDoi
ChuaChuyenDoi -> ĐẠi học quốc gia hà NỘi trưỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Thị Hương XÂy dựng quy trình quản lý CÁc công trìNH
ChuaChuyenDoi -> TS. NguyÔn Lai Thµnh
ChuaChuyenDoi -> Luận văn Cao học Người hướng dẫn: ts. Nguyễn Thị Hồng Vân
ChuaChuyenDoi -> 1 Một số vấn đề cơ bản về đất đai và sử dụng đất 05 1 Đất đai 05
ChuaChuyenDoi -> Lê Thị Phương XÂy dựng cơ SỞ DỮ liệu sinh học phân tử trong nhận dạng các loàI ĐỘng vật hoang dã phục vụ thực thi pháp luật và nghiên cứU
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Hà Linh
ChuaChuyenDoi -> ĐÁnh giá Đa dạng di truyền một số MẪu giống lúa thu thập tại làO
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiêN
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Văn Cường

tải về 361.36 Kb.

Chia sẻ với bạn bè của bạn:
1   2   3   4   5   6   7




Cơ sở dữ liệu được bảo vệ bởi bản quyền ©hocday.com 2024
được sử dụng cho việc quản lý

    Quê hương