Encephalomyocarditis virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Enterovirus
|
|
|
|
Human enterovirus A, B, C, D
|
2
|
Cấp II
|
|
Poliovirus (thuộc Human enterovirus C)
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Bảo quản, thử nghiệm các chủng hoang dại
|
Hepatovirus
|
|
|
|
Hepatitis A virus
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích với số lượng mẫu lớn, dễ tạo khí dung
|
Parechovirus
|
|
|
|
Humanparechovirus
|
2
|
Cấp II
|
|
Rhinovirus
|
|
|
|
Human rhinovirus A
|
2
|
Cấp II
|
|
Human rhinovirus B
|
2
|
Cấp II
|
|
Polyomaviridae
|
|
|
|
Polyomavirus
|
|
|
|
BK polyomavirus
|
2
|
Cấp II
|
|
JC polyomavirus
|
2
|
Cấp II
|
|
Simian virus 40 (SV40)
|
2
|
Cấp II
|
|
Poxviridae
|
|
|
|
Molluscipoxvirus
|
|
|
|
Molluscum contagiosum virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Orthopoxvirus
|
|
|
|
Cowpox virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Monkeypox virus
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Thí nghiệm trên động vật
|
Vaccinia virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Variola virus
|
4
|
Cấp IV
|
|
Yatapoxvirus
|
|
|
|
Tanapox virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Yaba monkey tumor virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Prion
|
|
|
|
Mammalian prions (thuộc spongiform Encephalopathies)
|
2
|
Cấp II
|
|
Bovine spongiform encephalopathy (BSE)
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Thí nghiệm trên động vật
|
Creutzfeldt-Jakob disease (CJD)
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Thí nghiệm trên động vật
|
Reoviridae
|
|
|
|
Coltivirus
|
|
|
|
Colorado tick fever virus
|
3
|
Cấp III
|
|
Rotavirus
|
|
|
|
Rotavirus A, B, C, D, E
|
2
|
Cấp II
|
|
Retroviridae
|
|
|
|
Deltaretrovirus
|
|
|
|
Primate T-lymphotropic virus 1
(Human T-lymhpotropic virus 1)
|
2
|
Cấp II
|
|
Primate T-lymphotropic virus 2
(Human T-lymhpotropic virus 2)
|
2
|
Cấp II
|
|
Lentivirus
|
|
|
|
Human immunodeficiency virus 1
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Nuôi cấy, phân lập, thí nghiệm trên động vật
|
Human immunodeficiency virus 2
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Nuôi cấy, phân lập, thí nghiệm trên động vật
|
Simian immunodeficiency virus
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Nuôi cấy, phân lập, thí nghiệm trên động vật
|
Rhabdoviridae
|
|
|
|
Lyssavirus
|
|
|
|
Lyssavirus
|
3
|
Cấp III
|
|
Rabies virus
|
3
|
Cấp II: Mổ động vật để lấy bệnh phẩm và làm tiêu bản,xét nghiệm trên vi rút đã bất hoạt,sử dụng vi rút giảm độc lực với các kỹ thuật không tạo khí dung
|
Cấp III: Tất cả các kỹ thuật xét nghiệm bệnh phẩm nghi ngờ chứa vi rút sống, chủng hoang dại; trung hòa vi rút trên tế bào;xét nghiệm có tạo khí dung; nuôi cấy số lượng lớn vi rút giảm độc lực
|
Vesiculovirus
|
|
|
|
Vesicular stomatitis Alagoas virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Togaviridae
|
|
|
|
Alphavirus
|
|
|
|
Bebaru virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Chikungunya virus
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích với số lượng mẫu lớn, dễ tạo hạt khí dung
|
Eastern equine encephalitis virus
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích với số lượng mẫu lớn, dễ tạo hạt khí dung
|
Getah virus
|
3
|
Cấp III
|
|
Mayaro virus
|
3
|
Cấp III
|
|
O’nyong-nyong virus
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích với số lượng mẫu lớn, dễ tạo hạt khí dung
|
Semliki Forest virus
|
3
|
Cấp III
|
|
Sindbis virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Nuôi cấy, phân lập
|
Western equine encephalitis virus
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích với số lượng mẫu lớn, dễ tạo khí dung
|
Rubivirus
|
|
|
|
Rubella virus
|
2
|
Cấp II
|
|
Unassingned
|
|
|
|
Deltavirus
|
|
|
|
Hepatitis D virus (vi rút viêm gan D)
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích với số lượng mẫu lớn, dễ tạo khí dung
|
B. VI KHUẨN NỘI BÀO BẮT BUỘC
|
|
|
|
Anaplasmataceae
|
|
|
|
Ehrlichia
|
|
|
|
Ehrlichia canis
|
2
|
Cấp II
|
|
Ehrlichia chaffeensis
|
3
|
Cấp III
|
|
Ehrlichia sennetsu
|
3
|
Cấp III
|
|
Chlamydiaceae
|
|
|
|
Chlamydia
|
|
|
|
Chlamydia pecorum
|
2
|
Cấp II
|
|
Chlamydia pneumoniae
|
2
|
Cấp II
|
|
Chlamydia psittaci (Trừ C.psittaci ở gia cầm)
|
2
|
Cấp II
|
|
Chlamydia trachomatis
|
2
|
Cấp II
|
|
Coxiellaceae
|
|
|
|
Coxiella
|
|
|
|
Coxiella burnetii
|
3
|
Cấp III
|
|
Rickettisaceae
|
|
|
|
Orientia
|
|
|
|
Orientia tsutsugamushi
|
3
|
Cấp III
|
|
Rickettisa
|
|
|
|
Nhóm typhus
|
3
|
Cấp III
|
|
Nhóm Spotted fever
|
3
|
Cấp III
|
|
Simkaniaceae
|
|
|
|
Simkania
|
|
|
|
Simkania negevensis
|
2
|
Cấp II
|
|
C. VI KHUẨN
|
|
|
|
Abiotrophia
|
|
|
|
Abiotrophia spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Acidovorax
|
|
|
|
Acidovorax spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Acinetobacter
|
|
|
|
Acinetobacter spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Actinobacillus
|
|
|
|
Actinobacillus spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Actinomadura
|
|
|
|
Actinomadura madurae
|
2
|
Cấp II
|
|
Actinomadura pelletieri
|
2
|
Cấp II
|
|
Actinomyces
|
|
|
|
Actinomyces bovis
|
2
|
Cấp II
|
|
Actinomyces israelii
|
2
|
Cấp II
|
|
Actinomyces pyogenes
|
2
|
Cấp II
|
|
Actinomyces viscosus
|
2
|
Cấp II
|
|
Aeromonas
|
|
|
|
Aeromonas hydrophilia
|
2
|
Cấp II
|
|
Aeromonas sobria
|
2
|
Cấp II
|
|
Afipia
|
|
|
|
Afipia spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Agrobacterium
|
|
|
|
Agrobacterium radiobacter
|
1
|
Cấp I
|
|
Arcanobacterium
|
|
|
|
Arcanobacteriumhaemolyticum
|
2
|
Cấp II
|
|
Bacillus
|
|
|
|
Bacillus anthracis
|
3
|
Cấp II: Sinh học phân tử, nhuộm soi vi khuẩn đã bất hoạt (có thể thực hiện kỹ thuật PCR trực tiếp từ vẩy da của bệnh nhân than thể da)
|
Cấp III: Xử lý mẫu bệnh phẩm, phân lập, xét nghiệm với vi khuẩn chưa bất hoạt
|
Bacillus cereus
|
2
|
Cấp II
|
|
Bacillus subtilis
|
1
|
Cấp I
|
|
Bacillus thuringiensis
|
1
|
Cấp I
|
|
Bacteroides
|
|
|
|
Bacteroides fragilis
|
2
|
Cấp II
|
|
Bartonella
|
|
|
|
Bartonella bacilliformis
|
2
|
Cấp II
|
|
Bartonella clarridgeiae
|
2
|
Cấp II
|
|
Bartonella elizabethae
|
2
|
Cấp II
|
|
Bartonella henselae
|
2
|
Cấp II
|
|
Bartonella quintana
|
2
|
Cấp II
|
|
Bartonella vinsonii
|
2
|
Cấp II
|
|
Bartonella weisii
|
2
|
Cấp II
|
|
Bordetella
|
|
|
|
Bordetella bronchiseptica
|
2
|
Cấp II
|
|
Bordetella ovis
|
2
|
Cấp II
|
|
Bordetella parapertussis
|
2
|
Cấp II
|
|
Bordetella pertussis
|
2
|
Cấp II
|
|
Borrelia
|
|
|
|
Borrelia spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Brucella
|
|
|
|
Brucella spp.
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Nuôi cấy, tăng sinh
|
Burkholderia
|
|
|
|
Burkholderia cepacia
|
2
|
Cấp II
|
|
Burkholderia mallei
|
3
|
Cấp III
|
|
Burkholderia pseudomallei
|
3
|
Cấp III
|
|
Calymmatobacterium
|
|
|
|
Calymmatobacterium granulomatis
|
2
|
Cấp II
|
|
Campylobacter
|
|
|
|
Campylobacter coli
|
2
|
Cấp II
|
|
Campylobacter fetus
|
2
|
Cấp II
|
|
Campylobacter jejuni
|
2
|
Cấp II
|
|
Capnocytophaga
|
|
|
|
Capnocytophaga canimorsus
|
2
|
Cấp II
|
|
Chryseobacterium
|
|
|
|
Chryseobacterium meningosepticum
|
2
|
Cấp II
|
|
Chryseomonas
Chryseomonas luteola
|
2
|
Cấp I
|
|
Chlamydia
|
|
|
|
Chlamydia spp. (ngoại trừ chủng nhiễm trên gia cầm C.psittaci)
|
2
|
Cấp II
|
|
Chromobacterium
Chromobacterium violacerum
|
2
|
Cấp I
|
|
Citrobacter
Citrobacter freundii
Citrobacter koseri
|
2
|
Cấp II
|
|
Clostridium
|
|
|
Clostridium spp. (ngoại trừ những sinh vật không gây bệnh)
|
2
|
Cấp II
|
|
Comamonas
Comamonas testosteroni
|
2
|
Cấp I
|
|
Corynebacterium
|
|
|
|
Corynebacterium diphtheria
|
2
|
Cấp II
|
|
Corynebacterium jeikeium
|
2
|
Cấp II
|
|
Corynebacterium pseudodiphtheriticum
|
2
|
Cấp II
|
|
Corynebacterium pseudotuberculosis
|
2
|
Cấp II
|
|
Corynebacterium renale
|
2
|
Cấp II
|
|
Corynebacterium ulcerans
|
2
|
Cấp II
|
|
Coxiella
|
|
|
|
Coxiella burnetii
|
3
|
Cấp III
|
|
Dermatophilus
|
|
|
|
Dermatophilus congolensis
|
2
|
Cấp II
|
|
Edwardsiella
|
|
|
|
Edwardsiella tarda
|
2
|
Cấp II
|
|
Eikenella
|
|
|
|
Eikenella corrodens
|
2
|
Cấp II
|
|
Enterobacter
|
|
|
|
Enterobacter aerogenes
|
2
|
Cấp II
|
|
Enterobacter cloacae
|
2
|
Cấp II
|
|
Enterobacter amnigenus
|
2
|
Cấp II
|
|
Enterococcus
|
|
|
|
Enterococcus faecalis
|
2
|
Cấp II
|
|
Enterococcus faecium
|
2
|
Cấp II
|
|
Erysipelothrix
|
|
|
|
Erysipelothrix rhusiopathiae
|
2
|
Cấp II
|
|
Escherichia
|
|
|
|
Escherichia coli chủng K12
|
1
|
Cấp I
|
|
Escherichia coli (trừ chủng K12, O157:H7, O103)
|
2
|
Cấp II
|
|
Escherichia coli O157:H7
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích với số lượng mẫu lớn, dễ tạo khí dung
|
Escherichia coli O103
|
3
|
Cấp III
|
|
Francisella
|
|
|
|
Francisella novocida
|
2
|
Cấp II
|
|
Francisella tularensis
|
3
|
Cấp II
|
|
Fusobacterium
|
|
|
|
Fusobacterium necrophorum
|
2
|
Cấp II
|
|
Gardnerella
|
|
|
|
Gardnerella vaginalis
|
2
|
Cấp II
|
|
Gordonia
|
|
|
|
Gordonia spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Haemophilus
|
|
|
|
Haemophilus actinomycetemcomitans
|
2
|
Cấp II
|
|
Haemophilus aegyptius
|
2
|
Cấp II
|
|
Haemophilus ducreyi
|
2
|
Cấp II
|
|
Haemophilus influenzae
|
2
|
Cấp II
|
|
Helicobacter
|
|
|
|
Helicobacter pylori
|
2
|
Cấp II
|
|
Kingella
|
|
|
|
Kingella kingae
|
2
|
Cấp II
|
|
Klebsiella
|
|
|
|
Klebsiella oxytoca
|
2
|
Cấp II
|
|
Klebsiella pneumoniae
|
2
|
Cấp II
|
|
Lactobacillus
|
|
|
|
Lactobacillusacidophilus
|
1
|
Cấp I
|
|
Legionella
|
|
|
|
Legionella spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Leptospira
|
|
|
|
Leptospira spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Listeria
|
|
|
|
Listeria monocytogenes
|
2
|
Cấp II
|
|
Micrococcus
|
|
|
|
Micrococcusleuteus
|
1
|
Cấp I
|
|
Moraxella
|
|
|
|
Moraxellacatarrhalis
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium
|
|
|
|
Mycobacterium asiaticum
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium avium
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium chelonae
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium fortuitum
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium intracellulare
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium kansasii
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium malmoense
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium marinum
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium paratuberculosis
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium scrofulaceum
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium simiae
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium szulgai
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycobacterium africanum
|
3
|
Cấp II: Nhuộm soi, xử lý bệnh phẩm Xpert (có thể làm tại bàn xét nghiệm)
Cấp II, bổ sung thông khí cơ học đảm bảo số lần trao đổi khí của PXN 6-12 lần/giờ: Nuôi cấy, định danh
Cấp II, bổ sung thông khí cơ học đảm bảo số lần trao đổi khí của PXN ít nhất 10 lần/giờ, lọc khí thải bằng bộ lọc hiệu suất cao, nồi hấp tiệt trùng chất thải trong PXN: Kháng sinh đồ, lai với mẫu dò (LPA), định danh từ chủng
|
|
Mycobacterium bovis (Trừ BCG)
|
Mycobacterium tuberculosis
|
Mycobacterium xenopi
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycoplasma
|
|
|
|
Mycoplasma fermentans
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycoplasma hominis
|
2
|
Cấp II
|
|
Mycoplasma pneumoniae
|
2
|
Cấp II
|
|
Neisseria
|
|
|
|
Neisseria gonorrhoeae
|
2
|
Cấp II
|
|
Neisseria meningitidis
|
2
|
Cấp II
|
|
Neurospora
|
|
|
|
Neurosporacrassa
|
1
|
Cấp I
|
|
Nocardia
|
|
|
|
Nocardia spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Oligella
|
|
|
|
Oligella spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Pasteurella
|
|
|
|
Pasteurella multocida (trừ type huyết thanh chỉ gây bệnh ở động vật)
|
2
|
Cấp II
|
|
Pasteurella pneumotropica
|
2
|
Cấp II
|
|
Pasteurella ureae
|
2
|
Cấp II
|
|
Plesiomonas
|
|
|
|
Plesiomonas shigelloides (trực khuẩn mủ xanh)
|
2
|
Cấp II
|
|
Proteus
|
|
|
|
Proteus mirabilis
|
2
|
Cấp II
|
|
Proteus penneri
|
2
|
Cấp II
|
|
Proteus vulgaris
|
2
|
Cấp II
|
|
Pseudomonas
|
|
|
|
Pseudomonas aeruginosa
|
2
|
Cấp II
|
|
Pseudomonas fluorescens
|
2
|
Cấp I
|
|
Pseudomonas putida
|
2
|
Cấp I
|
|
Rahnella
Rahnella aquatilis
|
2
|
Cấp I
|
|
Rhodococcus
|
|
|
|
Rhodococcus equi
|
2
|
Cấp II
|
|
Salmonella
|
|
|
|
Salmonella choleraesuis
|
2
|
Cấp II
|
|
Salmonella enterica
|
3
|
Cấp III
|
|
Salmonella enteritidis
|
2
|
Cấp II
|
|
Salmonella serovars
|
2
|
Cấp II
|
|
Salmonella serovar paratyphi A
|
3
|
Cấp III
|
|
Salmonella serovar typhi
|
3
|
Cấp III
|
|
Salmonella typhi
|
2
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích số lượng mẫu lớn, dễ tạo khí dung
|
Serratia
|
|
|
|
Serratia marcescens
Serratia ficaria
Serratia liquefaciens
Serratia plymuthica
Serratia rubidaea
|
2
|
Cấp II
|
|
Shigella
|
|
|
|
Shigellaspp. (trừ Shigella dysenteriae -Type 1)
|
2
|
Cấp II
|
|
Sphaerophorus
|
|
|
|
Sphaerophorus necrophorus
|
2
|
Cấp II
|
|
Staphylococcus
|
|
|
|
Staphylococcus aureus
|
2
|
Cấp II
|
|
Stenotrophomonas
Stenotrophomons maltophillia
|
2
|
Cấp II
|
|
Streptobacillus
|
|
|
|
Streptobacillus moniliformis
|
2
|
Cấp II
|
|
Streptococcus
|
|
|
|
Streptococcus spp.
|
2
|
Cấp II
|
|
Tatlockia
|
|
|
|
Tatlockia micdadei
|
2
|
Cấp II
|
|
Treponema
|
|
|
|
Treponema carateum
|
2
|
Cấp II
|
|
Treponema pallidum
|
2
|
Cấp II
|
|
Treponema pertenue
|
2
|
Cấp II
|
|
Ureaplasma
|
|
|
|
Ureaplasma urealyticum
|
2
|
Cấp II
|
|
Vibrio
|
|
|
|
Vibrio cholerae
|
2
|
Cấp II
|
|
Vibrio fluvialis
|
2
|
Cấp II
|
|
Vibrio mimicus
|
2
|
Cấp II
|
|
Vibrio parahaemolyticus
|
2
|
Cấp II
|
|
Vibrio vulnificus
|
2
|
Cấp II
|
|
Yersinia
|
|
|
|
Yersinia enterocolitica
|
2
|
Cấp II
|
|
Yersinia pestis
|
3
|
Cấp II
|
Cấp III: Phân tích các chủng kháng thuốc
|
Yersinia pseudotuberculosis
|
2
|
Cấp II
|
|
|
|
