( TM: Tên mồi; x: Tổng số ellele dị hợp; y, z: Tổng số ellele khuyết)
Như vậy, qua kết quả bảng 3.8 cho thấy:
-
Số mồi thể hiện 5 allele: 1 mồi (RM153) tương ứng với kích thước (bp): 180, 190, 200, 210, 225.
-
Số mồi thể hiện 4 allele: 3 mồi (RM282, RM172, RM515) tương ứng với các kích thước (bp):
+ RM282: 85, 95,105, 110.
+ RM172: 150, 155, 160, 170.
+ RM515: 200, 210, 225, 235.
-
Số mồi thể hiện 3 allele: 6 mồi (RM13, RM135, RM143, RM224, RM171, RM245) tương ứng với các kích thước (bp):
+ RM13: 120, 135, 155.
+ RM135:120, 125, 135.
+ RM143: 235, 250, 275.
+ RM224: 130, 135, 150.
+ RM171: 310, 320, 350.
+ RM245:135, 145, 150.
-
Số mồi thể hiện 2 allele: 3 mồi (RM30, RM270, RM174, RM224) tương ứng với các kích thước (bp):
+ RM30: 125,130.
+ RM270: 105, 120.
+ RM174: 205, 220.
-
Số mồi thể hiện 1 allele: 2 mồi (RM142, RM162) tương ứng với các kích thước (bp):
+ RM142: 235.
+ RM162: 230.
Bảng 3.9: Số allele thể hiện và hệ số PIC của 15 cặp mồi SSR
TT
|
Tên Mồi
|
Vị trí trên NST
|
Số allele
|
PIC
|
1
|
RM13
|
5
|
3
|
0,39
|
2
|
RM30
|
6
|
2
|
0,36
|
3
|
RM282
|
3
|
4
|
0,70
|
4
|
RM135
|
3
|
3
|
0,40
|
5
|
RM142
|
4
|
1
|
0,00
|
6
|
RM143
|
3
|
3
|
0,40
|
7
|
RM270
|
12
|
2
|
0,48
|
8
|
RM153
|
5
|
5
|
0,74
|
9
|
RM162
|
6
|
1
|
0,00
|
10
|
RM171
|
10
|
3
|
0,30
|
11
|
RM172
|
7
|
4
|
0,56
|
12
|
RM174
|
2
|
2
|
0,36
|
13
|
RM224
|
11
|
3
|
0,38
|
14
|
RM245
|
9
|
3
|
0,46
|
15
|
RM515
|
8
|
4
|
0,56
|
Tổng
|
42
|
7,09
|
Trung bình
|
2,8
|
0,48
|
Qua kết quả thu được ở bảng 3.9, cho thấy: Với 15 cặp mồi SSR được sử dụng trong nghiên có 13 cặp mồi cho kết quả đa hình và 2 cặp mồi cho kết quả đơn hình - chỉ thu được 1 allele (RM142 và RM162). Tổng số allele thu được trên 15 cặp mồi SSR là 42 allele, trung bình 2,8 allele/cặp mồi.
Hệ số PIC trung bình của 15 cặp mồi nghiên cứu là 0,48. Trong đó:
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM13 là: 0,39.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM30 bằng cặp mồi RM174 là: 0,36.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM282 là: 0,70.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM135 bằng cặp mồi RM143 là: 0,40.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM142 bằng cặp mồi RM162 là: 0.00.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM270 là 0,48.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM153 là cao nhất: 0,74.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM171 là 0,30.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM172 là 0,56.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM224 là 0,38.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM245 là 0,46.
+ Giá trị PIC của cặp mồi RM515 là 0,56.
Hình 3.3: Ảnh điện di sản phẩm PCR của các giống lúa nghiên cứu
với cặp mồi RM245
Chia sẻ với bạn bè của bạn: |