TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiêN
ĐÁNH GIÁ CÁC GIÁ TRỊ HỮU ÍCH CỦA PHƯƠNG PHÁP
tải về 0.74 Mb.
|
- Điều hướng trang này:
- 2.3.2. Các chỉ số tính toán độ tin cậy và giá trị của phương pháp [3, 4]
- Bảng 2.3 . Bảng số liệu cơ bản để tính toán các chỉ số
- Bảng 2.4. Mức độ LR + , LR - liên quan đến khả năng mắc bệnh và không mắc bệnh
- CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
- 3.1.2. Lựa chọn các cặp mồi và tổ hợp mồi phù hợp
- Hình 3.1. Thử nghiệm các tổ hợp mồi phù hợp (từ tổ hợp 1 đến tổ hợp 8)
2.3. ĐÁNH GIÁ CÁC GIÁ TRỊ HỮU ÍCH CỦA PHƯƠNG PHÁP2.3.1. Tiêu chuẩn xác định chẩn đoán dương tính và âm tínhTiêu chuẩn chẩn đoán viêm màng não nghi do vi khuẩn liên cầu lợnliên cầu khuẩn lợn (S. suis):
Tiêu chuẩn chẩn đoán xác định viêm màng não do vi khuẩn liên cầu lợnliên cầu khuẩn lợn (S. suis) nhằm mục đích phân tích so sánh kết quả của phương pháp nuôi cấy phân lập và phương pháp PCR đa mồi như sau:
Viêm màng não không do vi khuẩn liên cầu lợnliên cầu khuẩn lợn (S. suis): Mẫu âm tính do không phải vi khuẩn liên cầu lợnliên cầu khuẩn lợn khi cấy bệnh phẩm không có S. suis và/hoặc không phát hiện được vật liệu di truyền của vi khuẩn bởi PCR. Chú ý: Tiêu chuẩn trên được sử dụng trong trường hợp phân tích, so sánh kết quả của phương pháp nuôi cấy và PCR đa mồi (phương pháp thử nghiệm). Kết quả của PCR đa mồi cũng được so sánh với kết quả phát hiện của PCR đơn mồi (được tiến hành trên cùng 1 mẫu bệnh phẩm). 2.3.2. Các chỉ số tính toán độ tin cậy và giá trị của phương pháp [3, 4]Các chỉ số gồm: độ nhậy (Se), độ đặc hiệu (Sp), tỷ lệ dương tính giả, tỷ lệ âm tính giả, giá trị tiên đoán dương tính (PPV), giá trị tiên đoán âm tính (NPV), tỷ số dự báo khả năng mắc bệnh khi xét nghiệm dương tính (LR+), tỷ số dự báo khả năng không mắc bệnh khi xét nghiệm âm tính (LR–). Bảng 2.3. Bảng số liệu cơ bản để tính toán các chỉ số
Độ nhạy hay tỷ lệ dương tính thật = a/(a+c) Độ đặc hiệu hay tỷ lệ âm tính thật = d/(b+d) Tỷ lệ dương tính giả = b/(b+d) Tỷ lệ âm tính giả = c/(a+c) Tỷ số dương khả dĩ - Tỷ số dự báo khả năng bệnh khi xét nghiệm dương tính (LR+) LR+ = Độ nhạy/ (1- độ đặc hiệu) Tỷ số âm khả dĩ - Tỷ số dự báo không mắc bệnh khi xét nghiệm âm tính (LR̶) LR- = (1- độ nhạy)/ độ đặc hiệu Giá trị dự đoán dương tính (PPV) = a/ (a+b) Giá trị dự đoán âm tính (NPV) = d/ (c+d)
CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN3.1. XÂY DỰNG QUY TRÌNH PCR ĐA MỒI PHÁT HIỆN TRỰC TIẾP Streptococcus suis VÀ MỘT SỐ ĐỘC LỰC PHỔ BIẾN CỦA VI KHUẨN3.1.1. Tạo bệnh phẩm mô phỏngBảng 3.1. Kết quả khẳng định lại đặc tính của vi khuẩn dùng làm mẫu
Để khẳng định lại các đặc tính của chủng vi khuẩn được sử dụng để tạo mẫu bệnh phẩm mô phỏng, nhóm nghiên cứu đã tiến hành thử nghiệm các đặc tính của chủng vi khuẩn như trong bảng 3.1 bao gồm tính chất bắt màu Gram, phản ứng catalase, nhóm kháng nguyên và định týp huyết thanh. Kết quả cho thấy chủng vi khuẩn đáp ứng đúng các đặc tính của týp huyết thanh 2 của vi khuẩn Streptococcus suis. Từ vi khuẩn S. Suis đã được khẳng định lại, nhóm nghiên cứu đã tạo được các huyền dịch vi khuẩn có nồng độ từ 107 vk/ µl đến 1vk/ µl và bộ bệnh phẩm DNA tinh khiết có nồng độ từ 107copy/ µl đến 1 copy/µl.
M: thang chuẩn DNA cỡ 100bp; TH: Tổ hợp mồi Ở tất cả các tổ hợp mồi, các băng DNA đều hiện rõ ở vị trí 498 bp (tương ứng với sản phẩm của cặp mồi Cps2J, đặc hiệu cho týp huyết thanh 2), và vị trí 248 bp (tương ứng với sản phẩm của cặp mồi đặc hiệu cho enzym ly giải tế bào sly. Như vậy hai cặp mồi Cps2J và Sly đều hoạt động rất tốt trong cả 8 tổ hợp. Đối với các tổ hợp mồi từ 1 đến 4, các vạch DNA là sản phẩm của mồi đặc hiệu cho S.suis 16S rDNA đều biểu hiện tốt.Tuy nhiên ở TH3 và TH4, cả 2 sản phẩm của cặp mồi Mrp có kích thước 188 bp đều không biểu hiện. Tất cả các tổ hợp từ 5 đến 8, sản phẩm của 2 cặp mồi Gdh và Cps2J biểu hiện không rõ ràng. Chỉ có TH1 và TH2, sản phẩm của tất cả các cặp mồi đều được biểu hiện, các vạch DNA phân tách rõ ràng, dễ quan sát. Каталог: files -> ChuaChuyenDoi ChuaChuyenDoi -> ĐẠi học quốc gia hà NỘi trưỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Thị Hương XÂy dựng quy trình quản lý CÁc công trìNH ChuaChuyenDoi -> TS. NguyÔn Lai Thµnh ChuaChuyenDoi -> Luận văn Cao học Người hướng dẫn: ts. Nguyễn Thị Hồng Vân ChuaChuyenDoi -> 1 Một số vấn đề cơ bản về đất đai và sử dụng đất 05 1 Đất đai 05 ChuaChuyenDoi -> Lê Thị Phương XÂy dựng cơ SỞ DỮ liệu sinh học phân tử trong nhận dạng các loàI ĐỘng vật hoang dã phục vụ thực thi pháp luật và nghiên cứU ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Hà Linh ChuaChuyenDoi -> ĐÁnh giá Đa dạng di truyền một số MẪu giống lúa thu thập tại làO ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiêN ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Văn Cường tải về 0.74 Mb. Chia sẻ với bạn bè của bạn:
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
