TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Thị Hải phân lập VI khuẩn khử sulphate (srb) ĐỂ Ứng dụng trong xử LÝ NƯỚc thải axit từ hoạT ĐỘng khai thác khoáng sảN


Phân tích thành phần quần xã vi sinh vật trong các mô hình xử lý AMD trong phòng thí nghiệm



tải về 438.76 Kb.
trang6/6
Chuyển đổi dữ liệu05.08.2016
Kích438.76 Kb.
#13693
1   2   3   4   5   6

3.4.3. Phân tích thành phần quần xã vi sinh vật trong các mô hình xử lý AMD trong phòng thí nghiệm

Để theo dõi thành phần của quần xã vi khuẩn trong các mô hình xử lý, đặc biệt là các vi khuẩn khử sulfate, chúng tôi tiến hành phân tích đoạn gen 16S rDNA bằng phương pháp điện di biến tính (DGGE) (hình 3.14).



E1.4 MH1 MH2 SR2 SR3 SR4


SR2: Desulfomicrobium sp.

SR3: Desulfobulbus sp.

SR4: Desulfovibrio sp.




SR3

SR2


SR4

*

*







**


Hình 3.14. Điện di biến tính (DGGE) gen 16S rDNA phân tích thành phần của quần xã vi khuẩn trong mô hình xử lý AMD.

Trước hết có thể thấy rằng ba chủng SRB phân lập được (đường điện di số 4, 5, 6) là đại diện của các nhóm vi khuẩn chiếm số đông trong mẫu làm giàu E1-4 (đường điện di số 1, các băng có mũi tên chỉ).

Trong quá trình vận hành mô hình xử lý với methanol là chất hữu cơ được bổ sung làm cơ chất cho SRB, cả 3 nhóm SRB mà các chủng SR2, SR3 và SR4 làm đại diện đều không được duy trì ở mật độ cao, thay vào đó là nhiều nhóm vi khuẩn khác phát triển, đặc biệt nhóm vi khuẩn ở băng đánh dấu * (đường điện di số 2).

Khi chất thải hữu cơ được bổ sung làm cơ chất cho SRB trong bể xử lý AMD, SR4 là đại diện của một trong các nhóm chính được tìm thấy (băng có mũi tên chỉ, đường điện di số 3). Bên cạnh đó hai nhóm khác ở các băng đánh dấu * và ** cũng là các nhóm chính nhưng chưa được xác định (đường điện di số 3).



Theo các tài liệu đã công bố, SRB thuộc chi Desulfovibrio có khả năng thích nghi với các môi trường có các yếu tố lý hóa nằm trong biên độ dao động lớn (Doshi, 2006), do vậy thường chiếm số đông và đóng vai trò quan trọng trong các hệ thống xử lý AMD (Doshi, 2006). Như vậy kết quả thu được trong nghiên cứu này cũng phù hợp với các kết quả đã công bố trước đây. Tuy nhiên, để có thể thu được bức tranh chi tiết hơn về các nhóm vi khuẩn trong mô hình xử lý 2 (sử dụng nước thải hữu cơ làm cơ chất), hai băng * và ** cần phải được giải trình tự, trên cơ sở đó đánh giá vai trò của chúng trong việc xử lý AMD như tham gia quá trình lên men yếm khí các chất hữu cơ để tạo cơ chất cho SRB hay là SRB trực tiếp tham gia vào việc khử sulfate thành sulfide.

KẾT LUẬN

  1. Đã thiết lập được hỗn hợp SRB (mẫu E1-4) có hoạt tính tốt trong điều kiện pH thấp qua phương pháp làm giàu.

  2. Phân lập được 3 chủng vi khuẩn khử sulfate SR2, SR3 và SR4 từ mẫu làm giàu nói trên. Dựa trên trình tự gần đủ của gen 16S rDNA các chủng này được định danh tương ứng là Desulfomicrobium sp. SR2, Desulfobulbus sp. SR3, và Desulfovibrio sp. SR4.

  3. Phân tích DGGE gen 16S rDNA cho thấy các chủng phân lập đại diện cho các nhóm SRB chính trong mẫu làm giàu E1-4.

  4. Nghiên cứu đặc điểm sinh lý của 3 chủng thấy rằng:

  • Cả 3 chủng đều có khả năng sinh trưởng tốt ở môi trường có hàm lượng muối 10 – 15 g/l, tương ứng với môi trường nước lợ. Đặc biệt là chủng SR4 có thể sinh trưởng tốt tại nồng độ muối 25 g/L, tương đương môi trường nước biển.

  • Cả ba chủng đều bị ức chế tại pH môi trường  6, tuy nhiên mẫu làm giàu gốc E1-4 thể hiện khả năng chịu pH thấp tốt hơn các chủng thuần khiết và sinh trưởng tốt ở pH 4 và 5.

  • Ba chủng đều sinh trưởng và tạo sulfide tối ưu ở 30oC và được xếp vào nhóm SRB ưa ấm điển hình.

  • Chất cho điện tử được cả 3 chủng sử dụng hiệu quả nhất là lactate. Chủng SR2 và SR3 còn sử dụng acetate và methanol nhưng với hiệu quả thấp hơn, trong khi đó SR4 hoàn toàn không sử dụng acetate.

  • Ngoài chất nhận điện tử chính là sulfate, 2 chủng SR2 và SR4 còn sử dụng được cả nitrate làm chất nhận điện tử. Ngoài ra, chủng SR4 còn oxy hóa được lactate bằng Fe3+.

  1. Mô hình thử nghiệm xử lý AMD với cơ chất bổ sung là nước thải có hàm lượng hữu cơ cao đạt hiệu quả cao hơn khi sử dụng cơ chất đơn là methanol. Kết quả thu được sau 7 ngày xử lý gồm: pH tăng từ 4 lên 8,15, nồng độ sulfate giảm từ 13,75 mM còn 4,5 mM, hàm lượng sắt giảm từ 200 mg/l còn 36 mg/l thể hiện khả năng ứng dụng thực tế của công nghệ.

  2. Phân tích điện di biến tính gen 16S rDNA cho thấy Desulfovibrio spp., đại diện là chủng SR4 đóng vai trò quan trọng trong bước xử lý AMD với nguồn cơ chất bổ sung là nước thải có hàm lượng hữu cơ cao.

HƯỚNG NGHIÊN CỨU TIẾP THEO

  1. Xác định các nhóm vi khuẩn khác SR4 cũng đóng vai trò quan trọng trong quá trình xử lý AMD ở MH2.

  2. Phân lập thêm các chủng SRB ưa axit để bổ sung vào mô hình xử lý AMD.

  3. Thử nghiệm áp dụng công nghệ ở quy mô lớn hơn trong điều kiện thực tế.


TÀI LIỆU THAM KHẢO

Tiếng việt

1. Công ty cổ phần tin học, công nghệ, môi trường, TCT Than & Khoáng sản Việt Nam (2012), Kết quả phân tích nước thải mỏ than.

2. Hồ Sỹ Giao, Mai Thế Toản (2010), “Những điểm nóng môi trường trong hoạt động khai thác mỏ ở Việt Nam”, Hội nghị khoa học kĩ thuật mỏ quốc tế 2010.

3. Bùi Công Quang (2011), “Tác động của các hoạt động khai thác mỏ đến nguồn nước và hệ sinh thái”, Chuyên đề bảo vệ môi trường trong khai thác khoáng sản, ĐH Thủy Lợi.

4. Nguyễn Danh Sơn (2011), “Môi trường và phát triển bền vững trong quản lý khai thác tài nguyên khoáng sản ở Việt Nam”, Chuyên đề bảo vệ môi trường trong khai thác khoáng sản, Viện Khoa học xã hội Việt Nam.

Tiếng Anh

5. Bahr M, Crump BC, Ceraj VK, Teske A, Sogin ML, Hobbie JE (2005), “Molecular chacterization of sulfate-reducing bacteria in a New England salt marsh”, Environ. Microbiol., 7, pp.1175–1185.

6. Ben-Dov E, Brenner A, Kushmaro (2007), “Quantification of sulfate-reducing bacteria in industrial wastewater by real-time polymerase chain reaction (PCR) using dsrA and apsA genes”, Microbiol. Ecol.,54, pp. 439–451.

7. Brenner FJ (2001), “Use of constructed wetlands for acid mine drainage abatement and stream restoration”, Water Sci. Technol., 44, pp. 449-454.

8. Benner SG, Blowes DW, Ptacek CJ (1997), “A full-scale porous reactive wall for prevention of acid mine drainage”, Ground Water Monit. Remed., 17, pp. 99-107.

9. Bharathi PAL, Sathe V, Chandramohan D (1990), “Effect of lead, mercury and cadmium on a Sulphate-reducing bacterium”, Environ. Pollut., 67, pp. 361–374.

10. Boetius A , Ravenschlag K, Schubert KJ, Rickert D, Widdel F, Gieseke A, Amann R, Jùrgensen BB, Witte U, Pfannkuche O (2000), “A marine microbial consortium apparently mediating anaerobic oxidation of methane”, Nature, 407, pp. 623–626.

11. Boschker HTS, Nold SC, Wellsbury P, Bos D, de Graaf W, Pel R, Parkes RJ,


Cappenberg (1998), “Direct linking of microbial populations to specific biogeochemical processes by 13C-labelling of biomarkers”, Nature, 392, pp. 801–804.

12. Boularbah A, Schwartz C, Bitton G, Morel JL (2006), “Heavy metal contamination from mining sites in South Morocco: 1. Use of a biotest to assess metal toxicity of tailings and soils”, Chemosphere, 63, pp. 802-810.

13. Brookens AM, Schmidt WT, Branch WL (2000), The effectiveness of utilizing passive treatment systems for leachate discharges in Western Maryland, Presented at the American Society for Surface Mining and Reclamation 17th Annual Meeting, Tampa, Florida, June 11-15, 2000.

14. Brown M, Barley B, Wood H (2002), Minewater treatment: technology, application and policy, IWA Publishing, London.

15. Brysch K, Schneider C, Fuchs G, Widdel F (1987), “Lithoautotrophic growth of sulphate-reducing bacteria, and description of Desulfobacterium autotrophicum gen. nov., sp. nov.”, Arch. Microbiol.,148, pp. 264–274.

16. Cabrera G, Pérez RJM, Gómez, Ábalos A, Cantero D (2006), “Toxic effects of dissolved heavy metals on Desulfovibrio vulgaris and Desulfovibrio sp. strains”, J. Hazar. Mater., 135, pp. 40-46.

17. Chaney RL, Brown SL, Angle JS, Stuczynski TI, Daniels WL, Henry CL, Siebielec G, Li YM, Malik M, Ryan JA, Compton H (2000), In situ Remediation/ Reclamation/Restoration of Metals Contaminated Soils using Tailor-Made Biosolids Mixtures, Symposium on Mining, Forest and Land Restoration: The Successful Use of Residuals/Biosolids/Organic Matter for Reclamation Activities, Denver, CO.

18. Cooper EL, Wagner CC (1973), “The effects of acid mine drainage on fish populations”, Fish and Food Organisms in Acid Waters of Pennsylvania, US Environmental Protection, EPA, pp. 32-114.

19. Cord-Ruwisch R (1985), “A quick method for the determination of dissolved and precipitated sulfides in cultures of sulfate-reducing bacteria”, J. Microbiol. Meth. 4, pp. 33-36.

20. Dar SA., Kuenen JG, Muyzer G (2005), “Nested PCR-denaturing gradient gel electrophoresis approach to determine the diversity of sulfate-reducing bacteria in complex microbial communities”, Appl. Environ. Microbiol., 71, pp. 2325–2330.

21. Dar SA, Stams AJ, Kuenen JG, Muyzer G (2007), “Co-existence of physiologically similar sulphate-reducing bacteria in a full-scale sulfidogenic bioreactor fed with a single organic electron donor”, Appl. Microbiol. Biotechnol., 75, pp. 1463–1472.

22. DIN 38406-E1-1 (1983), German standard methods for the examination of water, waste water and sludge, cation (group E), determination of iron (E1).

23. Doshi SM (2006), Bioremediation of Acid Mine Drainage Using Sulfate-Reducing Bacteria, Report for U.S. Environmental Protection Agency.

24. Dubilier N, Mülders C, Ferdelman T, de Beer D, Pernthaler A, Klein M, Wagner M, Erséus C, Thiermann F, Krieger J, Giere O, Amann R (2001), “Endosymbiontic sulphate-reducing and sulphide-oxidizing bacteria in an oligochaete worm”, Nature, 411, pp. 298–302.

25. Duffield S, Lucia AC, Mitchison N, Kasamas H, (2000), “Land recovery and man-made risks: a perspective from the EU accession countries”, J. Hazard. Mater.,78, pp. 91-103.

26. Elferink OSJWH, Visser A, Hulshoff-Pol LW, Stams AJM (1994), “Sulphate reduction in methanogenic bioreactors”, FEMS Microbiol. Rev., 15, pp. 119–136.

27. EPA (1995), Human Health and Environmental Damages from Mining and Mineral Processing Wastes, Washington DC, Office of Solid Waste, U.S. Environmental Protection Agency.

28. Farag, A. M., D.Skaar, D.A. Nimick, E. MacConnell, and C. Hogstrand (2003), "Characterizing aquatic health using salmonids mortality, physiology, and biomass estimates in streams with elevated concentrations of arsenic, cadmium, copper, lead, and zinc in the Boulder River Watershed, Montana", Transac. Amer. Fisher. Soc., 132, pp. 450-457.

29. Felsenstein J (1985), “Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap”, Evolution, 39, pp. 783-791.

30. Figueroa L (2005), Microbial ecology of anaerobic biosystems treating mining influenced waters, Presented at the Mine Water Treatment Technology Conference, Pittsburgh, PA.

31. Frauque, G., J.LeGall, and L. L. Barton (1991), “Sulphate-reducing and sulphur-reducing bacteria”, Variation in Autotrophic Life, pp. 271-337.

32. Fromm, P. O. (1980), "A review of some physiological and toxicological responses of freshwater fish to acid stress", Environ. Biol. Fishes, 5, pp. 79-93.

33. Gadd G (2004), “Microbial influence on metal mobility and application for bioremediation”, Geoderma, 122, pp. 109-119.

34. Gusek JJ, Wildeman TR (2002), Passive treatment of aluminum-bearing acid rock drainage, Proceedings of the 23rd Annual West Virginia Surface Mine Drainage Task Force Symposium, Morgantown, West Virginia, April 16-17, 2002.

35. Dinh TH, Kuever J, MaBmann M, Hassel AW, Martin Stratmann and Friedrich Weddel, “Iron corrosion by novel anaerobic microorganism”, Nature, 427, pp. 829-832.

36. Hao OJ, Chen JM, Huang L, Buglass RL (1996), “Sulphate reducing bacteria”, Crit. Rev. Enviro. Sci. Technol., 26, pp. 155-187.

37. Hao OJ, Huang L, Chen JM, Buglass RL (1994), “Effects of metal additions on sulphate reduction activity in wastewaters”, Toxicology and Environmental Chemistyi, 46, pp. 197-212.

38. Higgins JP, Hard BC, Mattes A (2003), Bioremediation of rock drainage using sulphate-reducing bacteria, Proceedings of Sudbury 2003: Mining and Environment, Sudbury, Ontario, May 25-28, 2003.

39. Hill RD (1974), Mining impacts on trout habitat, Proceedings of a Symposium on Trout Habitat, Research, and Management, Boone, NC, Appalachian Consortium Press.

40. Hilton BL, Oleszkiewiez JA (1988), “Sulfide induced inhibition of anaerobic digestion”, J. Environ. Eng., 114, pp. 1377–1391.

41. Hines ME, Evans RS, Genthner BRS, Willis SG, Friedman S, Rooney-Varga JN, Devereux R (1999), “Molecular phylogenetic and biogeochemical studies of sulfate-reducing bacteria in the rhizosphere of Spartina alterniflora”, Appl. Environ. Microbiol., 65, 2209–2216.

42. Howells GD, Brown DJA, Sadler K (1983), "Effects of acidity, calcium, and aluminum on fish survival and productivity - a review", J. Sci. Food Agr., 34(6), pp. 559-570.

43. Itoh T, Suzuki KI, Nakase T (1998), “Thermocladium modestius gen. nov., sp. nov. a new genus of rod-shaped, extremely thermophilic crenarchaeote”, Int. J. Syst. Bacteriol., 48, pp. 879–887.

44. Itoh T, Suzuki KI, Sanches PC, Nakase T (1999), “Caldivirga maquilingensis gen. nov., sp. nov. a new genus of rod-shaped crenarchaeote isolated from a hot spring in the Philippines”, Int. J. Syst. Bacteriol., 49, pp. 1157–1163.

45. Jage CR, Zipper CE, Hendricks AC (2000), Factors affecting performance of Successive Alkalinity-Producing Systems, Presented at the American Society for Surface Mining and Reclamation 17th Annual Meeting, Tampa, Florida, June 11-15, 2000.

46. Jennings SR, Neuman DR, Blicker PS (2008), Acid Mine Drainage and Effects on Fish Health and Ecology: A Review, Reclamation Research Group Publication, Bozeman MT.

47. Jeanthon C, Haridon SL, Cueff V, Banta A, Reysenbach AL, Prieur D (2002), “Thermodesulfobacterium hydrogeniphilum sp. nov., a thermophilic, chemolithoautotrophic sulfate-reducing bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal vent at Guaymas Basin and emendation of the genus Thermodesulfobacterium”, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 52, pp. 765–772.

48. Jong T, Parry DL (2006), “Microbial sulfate reduction under sequentially acidic conditions in an upflow anaerobic packed bed bioreactor”, Water Res., 40, pp. 2561-2571.

49. Kaksonen AH, Plumb JJ, Franzmann PD, Puhakaka JA (2004a), “Simple organic electron donors support diverse sulphate- reducing communities in fluidized-bed reactors treating acid metal- and sulphate-containing wastewater”, FEMS Microbiol. Ecol., 47, pp. 279–289.

50. Kaksonen AH, Plumb JJ, Franzmann PD, Puhakaka JA (2004b), “Effects of hydraulic retention time and sulphide toxicity on ethanol and acetate oxidation in sulphate reducing metal-precipitating fluidized-bed reactor”, Biotechnol. Bioeng., 86, pp. 332–343.

51. Kepler DA, McCleary EC (1994), “Successive alkalinity-producing systems (SAPS) for the treatment of acidic mine drainage”, Proceedings of the International Land Reclamation and Mine Drainage Conference and the Third International Conference on the Abatement of Acidic Drainage, Pittsburgh, PA, April 24-29, 1994, pp. 195-204.

52. Kniemeyer O, Musat F, Sievert SM, Knittel K, Wilkes H, Blumenberg M, Michaelis W, Classen A, Bolm C, Joye SB, Widdel F (2007), “Anaerobic oxidation of short-chain hydrocarbons by marine sulphate-reducing bacteria”, Nature, 449, pp. 898–901.

53. Kovacik WPJ (2006), “Molecular analysis of deep subsurface Cretaceous rock indicates abundant Fe(III)- and S°-reducing bacteria in a sulfate-rich environment”, Environ. Microbiol., 8, 141–155.

54. Kremer DR, Hansen TA (1988), “Pathway of propionate degradation in Desulfobulbus propionicus”, FEMS Microbiol. Lett., 49, pp. 273-277.

55. Laanbroek HJ, Geerligs HJ, Sijtsma L, Veldkamp H (1984), “Competition for sulfate and ethanol among Desulfobacter, Desulfobulbus, and Desulfovibrio species isolated from intertidal sediments”, Appl. Environ. Microbiol., 47, pp. 329–334.

56. Logan MV, Reardon KF, Figueroa LA, McLain JET, Ahmann DM (2005), “Microbial community activities during establishment, performance, and decline of bench-scale passive treatment systems for mine drainage”, Water Res., 39, pp. 4537-4551.

57. Lopez IFR, Larrea L, Cocolin E, Orr T, Phister M, Marshall J, Gheynst V, Mills DA (2003), “Design and evaluation of PCR primers for analysis of bacterial populations in wine by denaturing gradient gel electrophoresis”, Appl. Environ. Microbiol., 69, pp. 6801–6807.

58. Maillacheruvu KY, Parkin GF (1996), “Kinetics of growth, substrate utilization and sulphide toxicity for propionate, acetate and hydrogen utilisers in anaerobic systems”, Water Environ. Res., 68, pp. 1099–1106.

59. Marmur J (1961), “A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms”, J Mol Biol, 3, pp. 208-218.

60. McCartney DM, Oleszkiewicz JA. (1991), “Sulphide inhibition of anaerobic degradation of lactate and acetate”, Water Res., 25, pp. 203–209.

61. McCartney DM, Oleszkiewicz JA (1993), “Competition between methanogens and sulphate reducers: effect of COD: sulphate ratio and acclimation”, Water Environ. Res., 65, pp. 655–664.

62. Menendez R (1978), “Effects of acid water on Shavers Fork – a case history”, Surface mining and fish/wildlife needs in the Eastern United States., U.S. DOI, Fish and Wildlife Service, pp. 160-169.

63. Minz D, Flax JL, Green SJ, Muyzer G, Cohen Y, Wagner M, Rittmann EB, Stahl DA (1999), “Diversity of sulfate-reducing bacteria in oxic and anoxic regions of a microbial mat characterized by comparative analysis of dissimilatory sulfite reductase genes”, Appl. Environ. Microbiol. 65, pp. 4666–4671.

64. Munshower FF, Neuman DR, Jennings SR, Phillips GR (1997), “Effects of land reclamation techniques on runoff water quality from the Clark Fork River floodplain, Montana”, Washington, DC, EPA Office of Research and Development, pp. 199-208.

65. Mussmann M, Ishii K, Rabus R, Amann R (2005), “Diversity and vertical distribution of cultured and uncultured Deltaproteobacteria in an intertidal mud flat of the Wadden Sea”, Environ. Microbiol., 7, pp. 405–418.

66. Muyzer G, Stams AJM (2008), “The ecology and biotechnology of sulphate-reducing bacteria”, Nature, 6, pp. 441-454.

67. Nilsen RK, Beeder J, Thostenson T, Torsvik T (1996), “Distribution of thermophilic marine sulfate reducers in North Sea oil field waters and oil reservoirs”, Appl. Environ. Microbiol., 62, pp. 1793–1798.

68. Nordstrom DK, Alpers CN (1999), “Negative pH, efflorescent mineralogy, and consequences for environmental restoration at the Iron Mountain Superfund site, California”, National Acad. Sci., 96, pp. 3455-3462.

69. Nordstrom DK, Jenne EA, Averett RC (1977), “Heavy metal discharges into Shasta Lake and Keswick Reservoir on the Sacramento River, California – a reconnaissance during low flow”, U.S. Geological Survey. Open-File Report, pp. 76-49

70. Nordwick S, Zaluski M, Park B, Bless D (2006), “Advances in development of bioreactors applicable to the treatment of ARD”, Proceedings, 7th Int. Conf. on Acid Rcok Drainage, St. Louis, MO, March 26-30, 2006, ed. by R.I. Barnhisel, pp. 1410-1420.

71. O’Flaherty V, Colleran E (1998), “Effect of sulphate addition on volatile fatty acid and ethanol degradation in an anaerobic hybrid reactor. I: process disturbance and remediation”, Biores. Technol., 68, pp. 101–107.

72. Ollivier B, Caumette P, Garcia JL, Mah RA (1994), “Anearobic bacteria from hypersaline enviroments”, Microbiol. Rev., 58, pp. 27-38.

74. Peck HD, Lissolo T (1988), “Assimilatory and dissimilatorymsulphate reduction: enzymology and bio energentics”, The Ntrogen and Sulphur Cycles, pp. 99-132.

75. Perry RH, Green D (1984), Perry’s Chemical Engineer’s Handbook, 6th Ed. McGraw-Hill Book Company, Singapore.

76. Pfennig N, Widdel F, Truper HG (1981), “The dissimilatory sulphate reducing bacteria”, in The Prokaryotes, 2, pp. 926-940.

77. Postage JR (1984), The sulphate reducing bacteria, 2nd ed, Cambridge Univertsity Press, Cambridge.

78. Ramsing NB, Kühl M, Jørgensen BB (1993), “Distribution of sulfate-reducing bacteria, O2, and H2S in photosynthetic biofilms determined by oligonucleotide probes and microelectrodes”, Appl. Environ. Microbiol., 59, pp. 3840–3849.

79. Ravenschlag K, Sahm K, Knoblauch C, Jørgensen BB, Amann R. (2000), “Community structure, cellular rRNA content, and activity of sulfate-reducing bacteria in marine Arctic sediments”, Appl. Environ. Microbiol., 66, pp. 3592–3602.

80. Reis MAM, Almeida JS, Lemos PC, Carrondo MJT (1992), “Effect of hydrogen sulphide on growth of sulphate-reducing bacteria”, Biotechnol. Bioeng., 40, pp. 593–600.

81. Rissati JB, Capman WC, Stahl DA (1994), “Community structure of a microbial mat: the phylogenetic dimension”, Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 91, pp. 10173–10177.

82. Rodríguez L, Ruiz E, Alonso-Azcárate J, Rincón, J (2009), “Heavy metal distribution and chemical speciation in tailings and soils around a Pb–Zn mine in Spain”, J. Environ. Manag., 90 , pp. 1106-1116.

83. Rose AW, Alcorn GS, Phelps LB, Bower PR (2001), Case study of Pot Ridge Passive Treatment Systems, Cambria County, Pennsylvania, Presented at the American Society for Surface Mining and Reclamation 18th Annual National Meeting, Albuquerque, New Mexico, June 3-7, 2001.

84. Saitou N, Nei M (1987), “The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees”, Mol. Biol. Evol., 4, pp. 406-425.

85. Sass H, Wieringa E, Cypionka H, Babenzien HD, Overmann J (1998), “High genetic and physiological diversity of sulfate-reducing bacteria isolated from an oligotrophic lake sediment”, Arch. Microbiol., 170, pp. 243–251.

86. Schink B, Stams AJM (2006), “The Prokaryotes”, Springer Verlag, New York, pp. 309–335.

87. Schönheit P, Kristjansson JK, Thauer RK (1982), “Kinetic mechanism for the ability of sulphate reducers to out-compete methanogens for acetate”, Arch. Microbiol., 132, pp. 285–288.

88. Sen AM (2001), Acidophilic Sulphate Reducing Bacteria: Candidates for Bioremediation of Acid Mine Drainage Pollution, Thesis, Univ. Wales.

89. Singer P, Stumm W (1970), “Acid mine drainage: the rate determining step”, Science, 167, pp. 1121-1123.

90. Skousen J, Sextone A, Cliff J, Sterner P, Calabrese J, Ziemkiewicz P (1999), Acid mine drainage treatment with a combined wetland/anoxic limestone drain: greenhouse and field systems, Presented at the American Society for Surface Mining and Reclamation 16th Annual National Meeting, Scottsdale, Arizona, August 13-19, 1999.

91. Skousen J, Ziemkiewicz P (1996), Acid Mine Drainage Control and Treatment, 2nd Ed. National Research Center for Coal and Energy, National Mine Land Reclamation Center, West Virginia University, Morgantown, WV, pp. 362.



92. Spear JR, Figueroa LA, Honeyman BD (2000), “Modeling the removal of uranium U(VI) from aqueous solution in the presence of sulfate reducing bacteria”, Environ. Sci. Technol., 66, pp. 3711-3721.

93. Speece RE (1983), “Anaerobic biotechnology of industrial wastewaters”, Environ. Sci. Technol., 17, pp. 416A–427A.

94. Stadnitskaia A, Muyzer G, Abbas B, Coolena MJL, Hopmans EC, Baas M, van Weeringa TCE, Ivanovb MK, Poludetkina E, Sinninghe Damste JS (2005), “Biomarker and 16S rDNA evidence for anaerobic oxidation of methane and related carbonate precipitation in deep-sea mud volcanoes of the Sorokin Trough, Black Sea”, Mar. Geol., 217, pp. 67–96.

95. Stams AJ, Elferink OS, Westermann P (2003), “Metabolic interactions between methanogenic consortia and anaerobic respiring bacteria”, Adv. Biochem. Eng. Biotechnol., 81, pp. 31–56.



96. Stephenson SL, Studiar SM, McQuattie CJ (1995), “Effects of acidification on bryophyte communities in West Viginia moutain streams”, J. Environ. Qual., 24, pp. 116 – 125.

97. Teitzel GM, Parsek MR (2003), “Heavy metal resistance of biofilm and planktonic Pseudomonas aeruginosa”, Appl. Environ. Microbiol., 69, pp. 2313–2320.

98. Thauer RK, Jungermann K, Decker K (1977), “Energy conservation in chemotrophic anaerobic bacteria”, Bacteriol. Rev., 41, pp. 100-180.

99. Tsukamoto TK, Killion HA, Miller GC (2004), “Column experiments for microbial treatment of acid mine drainage: low-temperature, low-pH and matrix investigations”, Water Res., 38, pp. 1405-1418.

100. U.S.Department of Agriculture (USDA) and EPA Region III (2000), A Handbook of Constructed Wetlands, Report# 843F00003.

101. U.S.Department of Energy (US DOE) (1998), Research and Application of Permeable Reactive Barriers, Document# K0002000.

102. US EPA (2004a), Nationwide Identification of Hardrock Mining Sites, Report #2004-P-00005, Office of the Inspector General.

103. US EPA (2004b), Abandoned Mine Lands Team Reference Notebook.

104. Vega FA, Covelo EF, Andrade ML (2006), “Competitive sorption and desorption of heavy metals in mine soils: Influence of mine soil characteristics”, J. Colloid Interface Sci., 298, pp. 582-592.

105. Warner RW (1971), "Distribution of biota in a stream polluted by acid mine drainage", Ohio J. Sci., 71, pp. 202-215.

106. Watzlaf G, Schroeder K, Kleinmann R, Kairies C, Nairn R (2003), “The passive treatment of coal mine drainage”, US Department of Energy NETL, pp. 72.

107. Wawer C, Jetten MS, Muyzer G (1997), “Genetic diversity and expression of the NiFe hydrogenase large-subunit gene of Desulfovibrio spp. in environmental sample”, Appl. Environ. Microbiol., 61, pp.4360–4369.

108. Webster G, Watt LC, Rinna J, Fry JC, Evershed RP, Parkes RJ, Weightman AJ (2006), “A comparison of stable isotope probing of DNA and phospholipids fatty acids to study prokaryotic functional diversity in sulfate-reducing marine sediment enrichment slurries”, Environ. Microbiol., 8, pp. 1575–1589.

109.  Weisburg WG, Barns SM, Pelletier DA, Lane DJ (1991). "16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study". J. Bacteriol., 173: 697–703.

110. Weijma J, Gubbels F, Hulshoff Pol LW, Stams AJM, Lens P, Lettinga G (2002), “Competition for H2 between sulphate reducers, methanogens and homoacetogens in a gas-lift reactor”, Water Sci. Technol., 45, pp. 75–80.

111. Widdel F (1988), “Microbiology and ecology of sulphate- and sulphur-reducing bacteria”, in Biology of Anaerobic Microorganism, pp. 469-585.

112. Widdel F, Bak F (1992), “Gram-negative mesophilic sulfate-reducing bacteria”, in The Prokaryotes, 2nd ed. Spinger, Berlin Heidelberg New York, pp. 3352-3378.

113. Widdel F, Pfennig N (1984), “Dissimilatory sulfate- and sulfur-reducing bacteria”, Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, 1, pp. 663-679.

114. Widdel F, Hansen TA (1991), “The dissimilatory sulphate and sulphur reducing bacteria”, in The prokaryotes, pp. 583-624.

115. Younger PL, Banwart SA, Hedin RS (2002b), Mine water: hydrology, pollution, remediation, Dordrecht; Boston, Kluwer Academic Publishers.16, pp. 442.

116. Zeikus JG, Dawson MA, Thompson TE, Lugvorsen K, Hatchikian EC (1983), “Microbial ecology of volcanic sulphidogenesis: Isolation and characterization of Thermodesulfobacteria commune gen. nov. and sp. nov. J. Gen. Microbiol., 129, pp. 1159-1169.

117. Zhou J, Bruns MA, Tiedje JM (1996), “DNA recovery from soils of diverse composition”, Appl. Environ. Microbiol., 62, pp. 316-322.



PHỤ LỤC

Phụ lục 1. Các trình tự gen

SR2 16r DNA (1444 bp), Desulfomicrobium sp.

GGTATCCGAGCGACTTCGGGTAGAACCGACTCTCGTGGTGTGAACGGGCGGTGTGTCACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCCCGGCATGCTGATCCGGCGATTACTGAGCGATTCCAACTTCAGGCAGGCGAGTCGAAGACTGCAATCCGGACTATGGATGGGTTTTTTGAGATTCGCTCGACCTCACGGTTTCGCTGCCCTTTGTACCCACCATTGTAATACGTGTGGTAGCCCTAGGCGTAAGGGCCATGATGACTTGAAGTCATCCCCACCTTCTCTCCCGGTTAACGCGGGCAGTCTCCACAGAGTGCCCACCATTATGTGCTGGCAACTGAGAATAGGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACACCTCACGGCACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCGGTCTCTGGATTCCCCGAAGGGCACTCCCGCATCTCTGCAGGATTCCCAGGATGTCAAGCCTAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAAATAAACCACCATACTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTTCTTTGAGTTTCAGCCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGGATACTTAACGCGTTAGCTACGGCACCGAAGATCAAGTCCCCGACACCTAGTATCCATCGTTTACGGTGTGGACTACCACGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACACTTTCGCACCTCAACGTCAATACCTGTCCAGGTGGCCGCCTTCGCCACCGGTGTTCCTCCTGATATCTACGGATTTCACTCCTACACCAGGAATTCCGCCACCCTCTCCAGGATTCAAGCCCTGCAGTTTCAAAGGCAGTTCCACGGTTGAGCCGTGGGATTTCACCCCTGACTTACAAGGCCGCCTACGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGAATAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCCTCTAAAGGTACCGTCAAAACAAAGGCCTATTACACCAATGCCCGTTCTTCCCTTCCGACATGAGGTTTACGACCCGAAAGCCTTCATCCCTCACACGGCGTTGCTGCGTCAGGCTTTCGCCCATTGCGCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGACCGTGTTTCAGTTCCAGTGTGGCTGATCATCCTCTCAGACCAGCTACTCATCGTTGCCTTGGTAGGCCATTACCCTACCAACTAGCTAATGAGACGCGGGCTCATCCTCGGACGAATGCATATGCAGAGGCATCCTTTACCGACGTCTATTAAAAGCCAGACTATCCGGTATTAGCTCCACTTTCGCGGAGTTATTCCAAATCCAAGGGTAGATTACCCACGCGTTACTCACCCGTGCGCCACTCTACTCAGGGCCGAAGCCCCTTTCTCGTACGACTGCAAGGTGTTAGGAACGCCGCCGGCGTCTCCCATTCTGA



SR3 16r DNA (1438 bp), Desulfobulbus sp.

GCGCATCGCAGGCGGCGATGATTATCACATGCAAATCGAACGCGAAAGGGACTTCGGTCCTGAGTAAAGTGGCGCAAGGGTGACTATTACGTGTAGATAACCCGTCTTCATGTATGGAATAATACACCGAAAGGGGTACTAATACCGGATATTATTGCCTCATATAAGTTTTGCAAGCAAAGGTGGCATCTGATTCAAGCTACTGCATGTAGAGGCGTCTGCGTACCATGAGCTAGTAGGTAGGGTAATGGCCTACCTAGGCAACGATGGTGAGCGGGTCTGAGAGGATGATCCGCCACACTGGCACTGGAACACGGGCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATATTGCGCAATGGGGGCAACCCTGACGAAGCGACGCCGCGTGAGTGAGGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGATCTGTCAAGAGGAAAGAAATGCATAGCGGTTAATACCCGCTATGTTTGACGGTACCTCTAAAGGAAGCACAGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGCAGGCGGTTTGGTAAGTCAGATGTGAAAGCCCACGGCTTAACCGTGGAAGTGCATTTGATACTGCTAGACCTGAGTACCAGAGGGGAAAGTGGAATTCCCGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCGGGAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGCTGAGTACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCAACTAGATGTAGGGGGGTGTTGATCCATTCTGTGTCGCAGCTAACGCATTAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCCGGGAATCTTTCGGAAACGAGAGAGTGCCTTCATTAGAAGGAACCTGGAGACAGGTGCTGCATGGCAGTCGTCAGCTCGTGTCATGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGCCTTTAGTTGCCAGCAGTTCGGCTGGGCACTCTAAAGGGACGGCCGGTGTCAAACCGAAGAAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCTTTATGACCAGGGCTACACACGTACTTACAATGGCCGATACAAAGGGCAGGCCACATTGCGAAATGGAGCCAATCCCATAAAACCGCTCTCACTCCGAATTGAAGTCTGCAACTCGACTCCATGGAAGTTGGAATCCCTAGTAATCGCGGATCAGCAATGCCGCGGGGAAAACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACCGGAATCGGTTGTACCAAAAGCAGTA



SR4 16r DNA (1442 bp), Desulfovibrio sp.

GTTACCCCGACAGTTTTAGGTAGGAACCGACTTTCGTGGTGTAGACGGGCGGTGTGTAACAAGGCCCGGGAAAGTATTCACCCGGGACCATGCTGATCTCCGATATACAAGCGATTCCGACTTCACGGGGGTCGAATTGCAGACCCCTGATCCGGAATGGGACCGGTTTTTGGGGATTGGCTCCACCCTGCGGTCTCGCAAGCCCATTGTAACCCGCCATTGTAGTACGTGTGTAGCCCTGGGCGTAAGGCCCATGATGACTTGACGTCGTCCCCACCTTCCTTCCCCGTTGACCGAGGCGGTCTCCCTAGAGTGCCCGACATTACTCGCTGGCAACTAAGGACAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACCACCTCACGGCACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCACCCCGCTCCCCGAAGGGCACTCCTCCTTTTCGGGAGGATTCGAGGGATGTCAAACCCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATACTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAGCCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGGATGCTTAATGCGTTAACTGCGGCACCGAAGATCGCTCCCCGACACCTAGCATCCATCGTTTACAGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTACCTGTCCAGGTGGCCGCCTTCGCCACCGGTGTTCCTCCGGATATCTACGGATTTCACTCCTACACCCGGAATTCCGCCACCCTCTCCAGGACTCAAGTCTCCCAGTATCGAACGCAGTTCCCCGGTTGAGCCGAGGGCTTTCACGTCCGACTTAAAAGACGGCCTACGCGCGCTTTACGCCCAGTGATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCCTCTGGAAGTACCGTCAGTCCCAAGGCTTGTTCAGCCTTGAGAGGTTCTTCCTTCCTGACAGAGGTTTACGACCCGAAAGCCTTCTTCCCTCACACGGCGTCGCTGCGTCAGGGTTTCCCCCATTGCGCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGACCGTGTTTCAGTTCCAGTGTGGCTGATCATCCTCTCAGACCAGCTACCCATCGTTGCCTTGGTGGGCCATTACCCCACCAACAAGCTAATGGGACGCGGACTCATCTCATTGCGACAGCTTGCAAGCAGAGGCCGCCTTTCCCCCAACCGAAATTGGAGCGTATCCGGTATTAGCGGCAGTTTCCCGCCGTTATCCCAAACAATGAGGGAGATAATCCACGCGTTACTCACCCGTGCGCCGCTCTACTCAGGGACCGAAGCCCCCTTTCTCGCACGACTTGCACGTGTTAAGCACGCCCCCACCGTTGATCTG



Phụ lục 2. Các biểu đồ đường chuẩn







Каталог: files -> ChuaChuyenDoi
ChuaChuyenDoi -> ĐẠi học quốc gia hà NỘi trưỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Thị Hương XÂy dựng quy trình quản lý CÁc công trìNH
ChuaChuyenDoi -> TS. NguyÔn Lai Thµnh
ChuaChuyenDoi -> Luận văn Cao học Người hướng dẫn: ts. Nguyễn Thị Hồng Vân
ChuaChuyenDoi -> 1 Một số vấn đề cơ bản về đất đai và sử dụng đất 05 1 Đất đai 05
ChuaChuyenDoi -> Lê Thị Phương XÂy dựng cơ SỞ DỮ liệu sinh học phân tử trong nhận dạng các loàI ĐỘng vật hoang dã phục vụ thực thi pháp luật và nghiên cứU
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Hà Linh
ChuaChuyenDoi -> ĐÁnh giá Đa dạng di truyền một số MẪu giống lúa thu thập tại làO
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiêN
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Văn Cường

tải về 438.76 Kb.

Chia sẻ với bạn bè của bạn:
1   2   3   4   5   6




Cơ sở dữ liệu được bảo vệ bởi bản quyền ©hocday.com 2024
được sử dụng cho việc quản lý

    Quê hương