ĐÁnh giá Đa dạng di truyền một số MẪu giống lúa thu thập tại làO


Kết quả đánh giá đa dạng di truyền các mẫu giống lúa Lào bằng chỉ thị SSR



tải về 1.28 Mb.
trang16/20
Chuyển đổi dữ liệu07.07.2016
Kích1.28 Mb.
#1522
1   ...   12   13   14   15   16   17   18   19   20

3.2. Kết quả đánh giá đa dạng di truyền các mẫu giống lúa Lào bằng chỉ thị SSR

3.2.1. Tỷ lệ khuyết số liệu và dị hợp tử của các giống lúa nghiên cứu.


Dựa trên kết quả điện di sản phẩm PCR của 33 mẫu giống lúa Lào và giống đối chứng BT7 với 20 chỉ thị SSR, chúng tôi tiến hành đánh giá tỷ lệ khuyết số liệu (M%) và chỉ số dị hợp tử (H%) của các giống lúa. Kết quả trình bày ở bảng 3.9. Theo bảng 3.9, tỷ lệ khuyết số liệu lớn nhất là 10%, đó là mẫu giống LP36 (tương ứng với 2 chỉ thị không được khuếch đại, 4 mẫu có tỷ lệ khuyết số liệu là 5% (tương ứng với 1 chỉ thị không được khuếch đại, các mẫu còn lại không bị khuyết số liệu. Theo Marilyn Warburton (2000)[48], tỷ lệ khuyết số liệu của từng mẫu qua phản ứng PCR không vượt quá 15% thì mới nhận được kết quả đáng tin cậy khi sử dụng phần mềm NTSYSpc để phân tích và xử lý số liệu. Như vậy, đánh giá 20 chỉ thị với các mẫu nghiên cứu thì tất cả các mẫu nghiên cứu đều có tỷ lệ khuyết số liệu thấp hơn 15%, đây là kết quả đáng tin cậy để sử dụng cho tính toán các hệ số khác.

Từ kết quả của bảng 3.9, chúng tôi nhận thấy giống VL62 có tỷ lệ dị hợp tử cao nhất là 20%, mẫu này có 4 mồi xuất hiện 2 alen, giống OX01B có tỷ lệ dị hợp tử là 15%, tương ứng có 3 mồi xuất hiện 2 alen; 6 mẫu giống có tỷ lệ dị hợp tử là 5% tương ứng 1 mồi xuất hiện 2 alen; các mẫu giống còn lại đạt tỷ lệ đồng hợp tử là 100%. Giống đối chứng BT7 có tỷ lệ dị hợp tử là 0% , đây là giống lúa thuần đang được trồng phổ biến ở Việt Nam.


Bảng 3.9. Tỷ lệ khuyết số liệu và dị hợp tử của các giống lúa nghiên cứu


TT

Tên giống

M%

H%

-1

-2

-3

-4

1

LP16

0

0

2

VL22

0

0

3

HVL14

0

0

4

VL47

0

0

5

LP36

10

0

6

LP13

0

0

7

VL62

0

20

8

XK10

0

0

9

LP37

0

0

10

VL-NT

0

0

11

OX01B

0

15

12

LP10

0

0

13

LP21

0

5

14

XK08

0

0

15

LP03

0

0

16

VL26

0

0

17

LP30

0

0

18

VL33

5

0

19

LP29

5

5

20

LP04

0

0

21

VL67

0

5

22

LP15

0

0

23

VL74

5

0

24

LP26

5

5

25

VL55

0

0

26

VLCP

0

0

27

VL50

0

0

28

VL36

0

0

29

VL72

0

0

30

LP01

0

5

31

HVL22

0

5

32

VLKT

0

0

33

VL61

0

0

34

BT7 (ĐC)

0

0

Trung bình

0,88

1,91

Giá trị lớn nhất

10

20

Giá trị nhỏ nhất

0

0



3.2.2. Hệ số PIC, số alen thể hiện trên từng cặp mồi.


Kết quả phân tích đa hình của các chỉ thị SSR được tổng hợp trong bảng 3.10 . Với tổng số 20 locus SSR được phân tích, chúng tôi thu nhận được 82 alen, số alen/locus nằm trong khoảng từ 2 đến 10 alen, trung bình 4,1 alen/locus. Các chỉ thị cho số alen thấp nhất với 2 alen/locus là RM249, RM455, RM23788, nhiều nhất là RM152 với 10 alen/locus. Trung bình số alen/locus đạt được trong nghiên cứu này cao hơn nghiên cứu J. Nagaraju,(2002) [40] khi đánh giá 24 giống lúa Basmati cải tiến và Basmati truyền thống với số alen trung bình là 3,8 alen/locus. Tuy nhiên số lượng alen thu được trong nghiên cứu này thấp hơn của Yang (1994) [71] với 9,3 alen/locus khi đánh giá đa hình của 42 giống lúa với 100 mồi và nghiên cứu của Jain (2004) khi đánh giá quần thể lúa thơm Ấn Độ đã phát hiện trung bình 7,8 alen/locus với khoảng dao động từ 3-22 alen/locus. Hình 3.7- 3.8 là hình ảnh điện di sản phẩm PCR của một số chỉ thị SSR với 33 mẫu giống lúa nghiên cứu.



Каталог: files -> ChuaChuyenDoi
ChuaChuyenDoi -> ĐẠi học quốc gia hà NỘi trưỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Thị Hương XÂy dựng quy trình quản lý CÁc công trìNH
ChuaChuyenDoi -> TS. NguyÔn Lai Thµnh
ChuaChuyenDoi -> Luận văn Cao học Người hướng dẫn: ts. Nguyễn Thị Hồng Vân
ChuaChuyenDoi -> 1 Một số vấn đề cơ bản về đất đai và sử dụng đất 05 1 Đất đai 05
ChuaChuyenDoi -> Lê Thị Phương XÂy dựng cơ SỞ DỮ liệu sinh học phân tử trong nhận dạng các loàI ĐỘng vật hoang dã phục vụ thực thi pháp luật và nghiên cứU
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Hà Linh
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiêN
ChuaChuyenDoi -> TRƯỜng đẠi học khoa học tự nhiên nguyễn Văn Cường
ChuaChuyenDoi -> ĐÁnh giá thực trạng và ĐỀ xuất giải pháP

tải về 1.28 Mb.

Chia sẻ với bạn bè của bạn:
1   ...   12   13   14   15   16   17   18   19   20




Cơ sở dữ liệu được bảo vệ bởi bản quyền ©hocday.com 2024
được sử dụng cho việc quản lý

    Quê hương