Microsoft Word 8 61. 16 Le Thanh Huong doc
Bảng 4. Các số liệu về các chỉ thị mã vạch DNA sử dụng trong nghiên cứu
tải về 3.47 Mb. Chế độ xem pdf
|
Phương-pháp-CTGDPT-2018 (1)
| Bảng 4. Các số liệu về các chỉ thị mã vạch DNA sử dụng trong nghiên cứu.
18S ITS matK psbA-trnH rbcL Số lượng mẫu 11 11 11 11 11 Tỷ lệ nhân bản PCR thành công 100% 100% 100% 100% 100% Tỷ lệ đọc trình tự thành công 100% 100% 100% 100% 100% Kích thước đoạn gen so sánh (bp) 897 539 748 361 521 Khoảng cách giữa các trình tự khi so sánh theo cặp nucleotide 0,001 (0,000- 0,003) 0,032 (0,000-0,072) 0,012 (0,000-0,024) 0,020 (0,000-0,041) 0,006 (0,000-0,014) Phân tích quan hệ phát sinh loài Dựa vào các trình tự đã xác định được và các trình tự tương đồng trên GenBank, chúng tôi đã tiến hành phân tích định danh loài dựa trên phương pháp xây dựng cây phân loại. Các trình tự Outgroup được sử dụng từ 3 loài thuộc cùng họ Araliaceae với chi Nhân sâm: Aralia chinensis, Aralia elata, Aralia cordata. Khi so sánh 5 cây phân loại sử dụng 5 chỉ thị DNA mã vạch 18S, ITS, matK, psbA-trnH và rbcL và kết hợp với kết quả so sánh trình tự nucleotide, chúng tôi nhận thấy rằng vùng trình tự ITS cho kết quả có độ tin cậy cao nhất, tiếp đến là vùng trình tự psbA-trnH, cho phép phân biệt Sâm Ngọc Linh với các loài sâm khác trên thế giới. Kết quả này cũng phù hợp với các nhóm nghiên cứu DNA barcode trên chi Nhân sâm (Wen và Zimmer, 1996; Zuo et al., 2011; Vũ Huyền Trang et al., 2013). |