Microsoft Word 8 61. 16 Le Thanh Huong doc
Kết quả phân tích trình tự
tải về 3.47 Mb. Chế độ xem pdf
|
Phương-pháp-CTGDPT-2018 (1)
| Kết quả phân tích trình tự
Sử dụng DNA tinh sạch và các cặp mồi đã tổng hợp, các đoạn DNA đã được khuếch đại với kích thước lần lượt là 1050 bp, 800 bp, 850 bp, 390 bp và 600 bp tương ứng với kích thước của các vùng gen 18S, ITS, matK, psbA-trnH, rbcL. Kết quả xác định trình tự cho thấy các đoạn gen đã được khuếch đại chính xác. Các trình tự gen này được so sánh với 41 trình tự tương ứng ở 9 loài thuộc chi Nhân sâm trên GenBank, trong đó có Sâm Ngọc Linh (P. vietnamensis Ha et Grushv.), Tam thất hoang (P. stipuleanatus), Tam thất (P. notoginseng), Nhân sâm (P. ginseng), Sâm Nhật Bản (P. japonicus), Sâm Bắc Mỹ (P. quinquefolius), Sâm Ba lá (P. trifolius), Tam thất (P. pseudoginseng), Tam thất gừng (P. zingiberensis) (Bảng 1). Kết quả so sánh cho thấy có sai khác trong trình tự các vùng gen nghiên cứu. Cụ thể, khi so sánh tỷ lệ phần trăm tương đồng giữa các cặp trình tự, vùng 18S có độ tương đồng giữa các cặp trình tự cao nhất (Trình tự của các loài tương đồng trung bình đạt 99,87 %), tiếp đến là vùng rbcL, matK và psbA-trnH với tỷ lệ tương đồng trung bình lần lượt là 99,27 %, 98,66 % và 96,82 %. Mức độ đa hình thể hiện rõ trên vùng ITS với tỷ lệ tương đồng trung bình thấp nhất, chỉ đạt 96,50 % (Bảng 3). Tạp chí Công nghệ Sinh học 15(1): 63-72, 2017 67 Bảng 3. Tỷ lệ phần trăm tương đồng giữa các trình tự 18S ITS matK psbA-trnH rbcL |